פגיעה בפלורת המעיים

לפני כשלושה חודשים נטלתי אנטיביוטקה (ציפרודקס למשך שבוע) לאחר זיהום חיידקי (חיידק השיגלה) ומאז התחילו לי בעיות במערכת העיכול, בעיקר עצירויות תחושת אי התרוקנות ותחושת דחיפות.
הייתי אצל רופא גסטרו אשר אמר לי שאולי פגעתי באיזון של החיידקים הטובים במעיים ושלח אותי לעשות גם בדיקה לצליאק ורגישות ללקטוז.
הייתי רוצה לשאול כמה שאלות ששכחתי לשאול אותו.
1)אם אכן פגעתי בפלורת המעיים הדבר אמור להסתדר מעצמו?
2)כמה זמן בערך המצב הזה יכול להימשך עד ההחלמה?
3)האם השיפור במצב צריך להיות הדרגתי?
4) האם יש תרופה או תוסף שאני יכול ליטול כדי לשפר את המצב או לזרז את תהליך ההחלמה?