פרוטוקול ארוך בין התחלת השימוש בגונאל

את ה- GNRH agonist מתחילים לרוב ביום ה- 21 של המחזור הקודם (פרוטוקול ארוך) או ביום 1-2 של הווסת של המחזור האקטואלי יחד עם מתן של גונדוטרופינים (פרוטוקול קצר), הטיפול המשולב ניתן עד ליום בו ניתן HCG.
באופן כללי ניתן לומר שהתאמת הפרוטוקול נעשית בהתאם לגיל האישה,הרזרבה השחלתית שלה,הרקע ההורמונלי שלה,תגובות קודמות,נסיון הרופא,ותכנון הזמן של המטופל.
לפרוטוקול הארוך באופן כללי מספר יתרונות-רמות ההורמונים,מספר הזקיקים,מספר הביציות,שיעור הבציות הבוגרות,שיעור ההפריות,ושיעור ההשתרשות הינו גבוה יותר בקבוצת נשים צעירות עם רקע של תגובה שחלתית נורמלית או גבוהה,ובנשים עם שחלות פוליציסטיות.אולם רבים מהרופאים מעדיפים את הפרוטוקולים הקצרים בגלל שהם מצריכים פחות הורמונים,נמשכים זמן קצר יותר,כרוכים בפחות גירוי יתר שחלתי,ופחות מעמסה מבחינת המעקב והבקרה.
הפרוטוקול המועדף היום על מרבית המטפלים שהינו קל לביצוע מצריך מעקב קל יותר ונמצא בשליטה ובקרה אופטימליים ומאפשר אופציות טיפוליות אלטרנטיביות לגרימת ביוץ בעת תגובת יתר (שימוש ב-GNRH-agonist להשאת ביוץ) הינו פרוטוקול עם אנטגוניסטים(צטרוטיד,אורגלוטרן)ל-GNRH

הבדיקה לאחר 14 יום מיועדת לבדוק אם הושג דיכוי הורמונלי שחלתי הולם כדי להתחיל בטיפול להשראת הביוץ וגיוס אוכלוסיית זקיקים חדשה,תוך סינכרון אופטימלי בין הזקיקים