תרבית שתן חיובית והשנייה שלילית

שלום רב,
אני בהיריון בשבוע 13. לפני מספר ימים ביצעתי תרבית שתן שגרתית והתוצאה היתה כי התרבית חיובית וכי קיים חיידק בשם Enteroc. Faecalis. ביצעתי תרבית נוספת לאחר יומיים אך התרבית הנוספת חזרה שלילית. עד שהיו לי את התוצאות של התרבית השנייה, התחלתי כבר לקחת אנטיביוטיקה (מוקסיפן 500 מ"ג 3 פעמים ביום למשך שבוע). אתמול קיבלתי את התוצאות של התרבית השנייה, וכפי שכתבתי היא חזרה שלילית.
רופאת הנשים הנחתה אותי שגם אם התרבית השנייה תחזור שלילית להמשיך בכל זאת לקחת את האנטיביוטיקה, מכיוון שהתרבית הראשונה יצאה חיובית ולכן יש סיכוי שכן היה לי את החיידק, ומלבד זאת היא אמרה שמכיוון שאני מתכוונת לעשות בדיקת מי שפיר עלי לקחת אנטיביוטיקה כדי לוודא שאין אצלי חיידקים כלל לפני הבדיקה (כדי להימנע מזיהום). האם אתה ממליץ במצב שבו התרבית הראשונה חזרה חיובית והשנייה שלילית, להמשיך בכל זאת לקחת אנטיביוטיקה? תודה רבה מראש!